组织空间转录组学

借助我们原创的空间组学生物芯片技术,通过在组织切片上实现单细胞至亚细胞级分辨率的基因原位捕获,利用荧光原位杂交标记RNA分子,结合条形码编码,实现高通量基因检测,提供高分辨率的空间基因表达数据。

核心技术

利用表面经过化学修饰的纳米针阵列穿透细胞膜,通过修饰层特异性捕获RNA或分子信标以检测特定RNA,同时集成空间条形码,保留RNA分子的空间坐标信息,重建基因表达的空间分布。

适用范围

新鲜冷冻组织、FFPE样本、活体穿刺/活检组织、动物整体器官切片等样本。

核心优势

亚细胞级精度
纳米针尖端直径可穿透细胞核膜,直接捕获mRNA,实现细胞质区域基因表达分析。
FFPE 样本支持
可处理临床存档的石蜡包埋样本,适用于大规模回顾性研究
复杂组织穿透
金刚石纳米针可穿透骨骼等坚硬结构,扩展空间转录组学的应用范围。

应用场景

解析肿瘤异质性:空间转录组学可从免疫调控、代谢重编程、基因动态表达等多维度解析肿瘤异质性,涵盖免疫逃逸、细胞互作等方向。

解析肺部基因表达异质性:通过先验计算的基质参考数据,利用流形映射和最近邻识别方法,将基质结构与H&E染色切片及Visium坐标进行1:1关联。最终实现基质结构的空间定位,并分析成纤维细胞概率及基因/细胞类型富集,揭示肺部组织的空间分子特征。

揭示肿瘤微环境:通过空间图谱,可以研究免疫细胞与癌细胞的空间互作,以及肿瘤演化、瘤内微生物群和肺纤维化等机制,包括COVID-19肺炎、肿瘤微环境和肿瘤转移分析。涵盖肺发育、新冠肺炎、肺癌、肺纤维化,呈现肿瘤微环境、瘤内微生物等。